VEZI CE FACE DE FAPT INTESTINUL TĂU

Un rând pentru fiecare afecțiune, un cerc pentru fiecare organism pe care un studiu l-a măsurat efectiv în ea. Fiecare cerc este un link către acel studiu pe PubMed.

LPS este o bucată din peretele exterior al anumitor bacterii intestinale. Urmărește-o în patru pași, de la ce o crește în intestin până la afecțiunile alături de care au măsurat-o cercetătorii. Patru dintre acești pași sunt exact ce citește Gut Barrier Panel.

Mucoasa intestinului subțire are grosimea unei singure celule, iar proteine numite joncțiuni strânse acționează ca sigilii între aceste celule. Ocludina este unul dintre aceste sigilii. O altă proteină, zonulina, poate deschide joncțiunile. Când se slăbesc (permeabilitate intestinală crescută), mâncarea parțial digerată, deșeurile bacteriene și toxinele încep să treacă și să declanșeze sistemul imunitar [1][2][3].

Unul dintre cele mai studiate lucruri care trec este LPS (lipopolizaharida), o toxină eliberată de anumite bacterii intestinale. Chiar și cantități minuscule în sânge, numite endotoxemie metabolică, sunt suficiente ca să întrețină inflamația cronică [4][5]. Niveluri mai mari de LPS apar în obezitate, diabetul de tip 2, ficatul gras și bolile de inimă, de aceea tot mai multe cercetări indică bariera intestinală ca o cauză din amonte a inflamației, nu ca un efect secundar [4][5][6].

De fiecare dată când înghiți, trimiți o doză din gura ta direct în intestin. Toată ziua, în fiecare zi. Nu este o metaforă, este instalație, iar cercetătorii care au secvențiat gurile și scaunele acelorași oameni au găsit bacterii orale care fac în mod obișnuit acest drum și se stabilesc mai jos, mult mai des atunci când există o boală [28]. Asta înseamnă că gura ta nu este un sistem separat care se întâmplă să stea deasupra intestinului. Este ușa din față, iar orice trăiește în spatele ei este livrat mai departe.

Deci funcționează în ambele sensuri. O gură sănătoasă populează în liniște un intestin sănătos în fiecare zi, fără niciun efort, de aceea curățarea gurii este una dintre cele mai ieftine mișcări din amonte pe care le ai la dispoziție. O gură inflamată face opusul. Și gura are o barieră, iar în boala gingiilor bacteriile ei și toxinele lor ajung și ele în sânge. Cele mai rele dintre ele, în frunte cu Porphyromonas gingivalis, nu stau pe loc: perturbă chiar intestinul, scăzând proteinele joncțiunilor strânse și întreținând aceeași endotoxemie [11][12][13]. P. gingivalis a fost găsită și în arterele înfundate și în peste 90 la sută dintre creierele afectate de Alzheimer [21][22].

Candida înrăutățește lucrurile, iar cele două lucrează împreună. Candida afectează direct mucoasa intestinală cu toxina sa, candidalizina [15], iar sus în gură face echipă cu P. gingivalis, construind biofilme comune care ascund bacteriile de sistemul tău imunitar și de antifungice [14]. Este o alianță reală, nu două probleme care stau una lângă alta: levura le oferă bacteriilor acoperire, bacteriile forțează bariera să se deschidă, iar împreună o țin deschisă. Este un motiv important pentru care candida este atât de greu de îndepărtat și pentru care un intestin afectat se vindecă greu cât timp gura este încă inflamată.

Aceasta este piesa pe care aproape nimeni nu o verifică. Dacă ai făcut munca pentru intestin, ai ținut dieta luni întregi și candida tot nu scade, o gură inflamată care o repopulează în liniște de sus este unul dintre primele motive ascunse de exclus. Exact asta verifică Oral Microbiome Profile și de aceea stă în Runda 1, nu într-o listă de extra.

Dacă ai o predispoziție genetică, o barieră permeabilă este o parte recunoscută a modului în care pornește boala autoimună. Când proteinele nedigerate, fragmentele bacteriene și toxinele ajung în sânge, sistemul imunitar poate începe să își atace propriile țesuturi [3][7]. Aceasta este munca Dr. Alessio Fasano, care a descoperit zonulina și a arătat cum acționează ca o ușă spre inflamație și autoimunitate. Permeabilitatea crescută a fost documentată în sindromul de colon iritabil, bolile inflamatorii intestinale și diabetul de tip 1 [10].

Intestinul și creierul tău sunt într-o conversație permanentă în ambele sensuri: de-a lungul nervului vag, prin sistemul imunitar și prin substanțele chimice produse de bacteriile intestinale. Legătura aceasta are un nume, axa microbiotă-intestin-creier, și este unul dintre cele mai active domenii din neuroștiință în acest moment [23][24].

Bariera permeabilă din secțiunile de mai sus face parte din poveste. Când LPS și fragmentele bacteriene trec în sânge, inflamația care urmează nu se oprește la peretele intestinal. Cercetătorii care au măsurat răspunsurile imunitare la bacteriile intestinale la persoane cu depresie majoră au găsit crescuți markerii unei bariere permeabile și au propus această translocare ca parte din tabloul inflamator al depresiei [25].

Cea mai impresionantă cercetare merge în direcția opusă. Când bacteriile intestinale de la persoane cu depresie au fost transferate la animale crescute fără germeni, acele animale au preluat un comportament asemănător depresiei și schimbări de metabolism pe care animalele care au primit bacterii de la donatori sănătoși nu le-au avut [26][27]. Nu este o afirmație că bacteriile cauzează depresia la un om și nimeni nu o face. Înseamnă că intestinul nu este un spectator în privința stării tale și este una dintre puținele variabile din amonte pe care le poți măsura și pe care poți acționa cu adevărat.

Deci aceasta este o variabilă, una reală, și aproape nimeni nu o verifică. Anxietatea și depresia sunt serioase și merită îngrijire reală de la un specialist autorizat în sănătate mintală. Nimic de aici nu înlocuiește asta, iar un panou de laborator nu este un diagnostic. Dar dacă ai lucrat ani la mintea ta și nu te-ai uitat niciodată la intestin, aceasta este ușa pe care nu a deschis-o nimeni.

Dacă tot mănânci alimente la care reacționează sistemul tău imunitar, mucoasa intestinală rămâne inflamată, ceea ce hrănește permeabilitatea și împiedică vindecarea [8][9]. În mod normal, găsirea factorilor declanșatori înseamnă o dietă de eliminare lungă: scoți grupe întregi de alimente și le reintroduci încet. Testarea sare peste cea mai mare parte din asta. Afli exact care alimente sunt problema și le eviți doar pe acelea. Singura excepție este candida: dacă ai o suprapopulare, tot trebuie să eviți alimentele care o hrănesc cât timp o readuci la echilibru, indiferent de rezultatele sensibilităților.

Gingiile sănătoase nu sângerează, niciodată. Dacă ale tale sângerează când folosești ața dentară sau te speli pe dinți, asta este inflamație și unul dintre cele mai timpurii semne ale bolii gingiilor [16]. Un strat alb și gros pe limbă poate indica o candida orală [17]. Trei sau mai multe infecții fungice pe an înseamnă candida în aproximativ nouă cazuri din zece [18]. Cercetătorii iau în serios și legătura candidei cu cancerul: produce compuși cancerigeni precum acetaldehida, iar cele mai puternice dovezi o leagă de cancerul oral [19][20].

Panourile KBMO FIT (22, 132 sau 176 de alimente), fiecare combinat cu un Gut Barrier Panel, măsoară reactivitatea ta imunitară la anumite alimente și aditivi, plus cât de permeabilă este mucoasa. GI-MAP este un test de scaun bazat pe ADN care cartografiază bacteriile, levurile, paraziții și markerii digestiei, inflamației și activității imunitare, cu suplimente opționale pentru zonulină și StoolOMX. Oral Microbiome Profile cartografiază bacteriile din gura ta, inclusiv agenții patogeni parodontali. Trei uși: mâncarea, intestinul și gura.

Jess și-a făcut exact acest profil și rezultatul a arătat complexul roșu și complexul portocaliu, ceea ce arată și rezultatul celor mai mulți oameni. Nu avea simptome niciuna dintre dăți și dentistul lui nu îi pomenise niciodată de asta. A fost nevoie de o probă de salivă ca să se vadă.

A urmat o singură rutină zilnică, fără antibiotice: două probiotice orale (ProBiora și BLIS K12 și M18), o periuță sonică, un irigator oral, pastă de dinți cu nano hidroxiapatită și clătirile. La retestare complexul roșu era sub limita de detecție, iar organismul rămas din complexul portocaliu scăzuse la o mică parte din nivelul de pornire, bine în interiorul intervalului sănătos.

Detaliul care a făcut diferența: clătirea cu zinc a mers în rezervorul irigatorului oral, cu apă caldă. O clătire plimbată prin gură atinge suprafața dinților, dar complexul roșu trăiește jos, în punga gingivală, unde clătitul nu ajunge niciodată. Un irigator oral împinge aceeași soluție sub presiune direct în acea pungă. Aceleași produse pe care majoritatea oamenilor le au deja, o livrare complet diferită.

Fă-o în trei faze. Eliminare: clătire cu zinc în rezervor cât timp există o infecție activă. Confirmare: retestează pe la nouăzeci de zile, pentru că testul îți spune când ai terminat, nu calendarul. Repopulare: fără zinc, doar clătiri blânde, probiotice seara după periaj, ca să se așeze pe o suprafață curată și să colonizeze. Eliminarea complexului roșu îți ia și bacteriile bune, exact cum ar trebui să se întâmple, și exact de aceea faza a treia nu este opțională.

Două lucruri își au locul pe scaunul unui stomatolog biologic bun. Cere unui stomatolog biologic bun să îți măsoare pungile gingivale, pentru că numărul decide procedura: 1 până la 3 mm înseamnă tratament gingival, 4 mm și mai mult necesită detartraj și planare radiculară, iar distrugerea completă a biofilmului este scopul ambelor. Și începe protocolul cu cel puțin o zi înainte de acea curățare, nu după, pentru că orele de după un detartraj sunt cea mai deschisă fereastră pe care o va avea gura ta. Încă un lucru pe care nu îl pomenește nimeni: aceste organisme trec între oamenii care își împart saliva, așa că dacă rezultatul tău este pozitiv, roagă-ți partenerul să se testeze și să urmeze protocolul alături de tine.

Ia Pachetul pentru sănătate orală Citește toată povestea

Pe această pagină există două tipuri de test și ele îți dau lucruri foarte diferite.

Un test pe cip citește câteva sute de mii de poziții alese. 23andMe îți dă o arhivă zip de aproximativ 5 până la 7 megabytes care se deschide într-un fișier text simplu de aproximativ 15 până la 25 de megabytes, cu undeva între 550.000 și 700.000 de poziții. FamilyTreeDNA îți dă un CSV comprimat de aceeași mărime, deși eliberează doar pozițiile de care sunt siguri, așa că primești setul lor selectat, nu tot ce a citit aparatul.

Un test de secvențiere citește totul, aproximativ trei miliarde de poziții, de circa 30 de ori. Primești trei fișiere. BAM este alinierea completă și are între 80 și 120 de gigabytes, așa că planifică-ți spațiul de stocare înainte să îl descarci. FASTQ conține citirile brute. VCF este lista locurilor în care ADN-ul tău diferă de referință și este cel pe care îl vrea aproape fiecare instrument de analiză. Necomprimat are 10 până la 20 de gigabytes. Comprimat scade la aproximativ 1 până la 2 gigabytes.

Deci rezumatul cinstit este acesta. Un fișier de cip este suficient de mic cât să îl trimiți pe email. Un genom întreg nu este, iar pentru descărcare vei avea nevoie de spațiu real pe disc și de răbdare.

Majoritatea locurilor care îți citesc datele vor VCF-ul, și majoritatea îl vor comprimat. Mai întâi vestea bună: cele mai multe companii de secvențiere îți dau deja un fișier care se termină în .vcf.gz, iar .gz înseamnă că este deja comprimat. Dacă al tău se termină așa, ai terminat, sari complet peste asta și încarcă-l așa cum este.

Dacă fișierul tău se termină simplu în .vcf, iată cum îl comprimi.

Pe Mac sau pe Linux, deschide Terminal, mergi în folderul cu fișierul și rulează gzip -k yourfile.vcf. Opțiunea -k păstrează originalul în loc să îl înlocuiască, ceea ce contează când descărcarea fișierului a durat o zi. Vei obține yourfile.vcf.gz lângă el.

Pe Windows, instalează 7-Zip, apoi dă click dreapta pe fișier, alege 7-Zip, alege Add to archive și setează formatul arhivei la gzip. Vei obține același rezultat .vcf.gz.

Dacă ai deja instalate instrumente de bioinformatică, bgzip yourfile.vcf este standardul din genomică și câteva instrumente îl cer în mod special. Simplul gzip este acceptat aproape peste tot în rest, așa că nu instala nimic pentru asta decât dacă ți-o cere un instrument.

Un lucru bun de știut înainte să începi. Comprimarea VCF-ului unui genom întreg durează ceva și necesită spațiu liber pe disc pentru ambele copii deodată. Fă-o când nu ai nevoie de calculator.

Niciunul dintre acestea nu este al meu și nu câștig nimic de pe urma lor. Sunt pur și simplu locurile unde merge fișierul după ce îl ai. Prețurile se schimbă, așa că verifică înainte să plătești.

Promethease este cel mai cuprinzător dintre ele. Îți compară fișierul cu SNPedia și îți întoarce mii de asocieri și funcționează din 2008. Limita de încărcare este de 4 gigabytes, așa că încape VCF-ul comprimat al unui genom întreg.

Genetic Genie rulează gratuit panouri de metilare și detoxifiere, adică exact ce caută majoritatea oamenilor din lumea medicinei funcționale. Limita lor de încărcare este de 1 gigabyte, iar propriile lor indicații spun că o secvențiere mai profundă dă rezultate mai precise. Un fișier de cip încape mereu. Un genom întreg comprimat uneori nu încape, iar dacă al tău trece de limită, va trebui să îl filtrezi mai întâi, ceea ce depășește cu adevărat o instrucțiune rapidă ca aceasta.

SelfDecode funcționează pe bază de abonament și este cel mai finisat din grup. Xcode Life și NutraHacker vând amândouă rapoarte individuale, pe rând. GEDmatch este pentru găsirea rudelor, nu pentru sănătate, și acceptă încărcări de la majoritatea companiilor de testare, așa se potrivesc oamenii între servicii care nu comunică între ele.

Înainte să încarci undeva, uită-te ce spune site-ul acela că face cu fișierul tău. Predai cea mai identificabilă informație pe care o ai, iar ea îți identifică și rudele de sânge, pe care nu le-a întrebat nimeni.

Fiecare dintre aceste companii îți va da fișierul, dar doar câteva îl pun la un click distanță. Restul te pun să îl cauți, iar una dintre ele pune și un cronometru. Iată unde se află descărcarea la fiecare, conform ultimei mele verificări. Meniurile se schimbă, așa că dacă un pas nu se potrivește, caută în centrul lor de ajutor cuvintele raw data.

Sequencing.com: autentifică-te, deschide My Genomes, alege genomul, apoi fila Files din partea stângă. Fiecare fișier (FASTQ, BAM, VCF) are propria descărcare în coloana Actions, iar aceeași coloană conține coșul de gunoi când ești gata să ștergi.

Nucleus: autentifică-te, deschide setările contului (Account) sau alege Downloads din meniul de sub numele tău. Poți lua VCF, CRAM, FASTQ și fișierele structurale și de număr de copii, plus o copie deja formatată pentru Promethease sau GEDmatch. Pentru ștergere, scrie la concierge@mynucleus.com de pe adresa asociată contului.

Dante Labs: autentifică-te, deschide Genome Manager și descarcă de acolo. Două avertismente. Fiecare link de descărcare expiră la 60 de secunde după ce dai click, așa că pornește transferul imediat și nu păstra linkul pentru mai târziu. Iar clienții au raportat că FASTQ și BAM dispar din cont după prima lună, în timp ce VCF rămâne, așa că ia fișierele mari devreme. Ștergerea se cere prin support.dantelabs.com.

FamilyTreeDNA: activează mai întâi autentificarea în doi pași, descărcarea refuză să pornească fără ea. Apoi Results & Tools, Autosomal DNA, Download Raw Data și ia fișierul Build 37 Concatenated. Nu îl dezarhiva și nu îl redenumi, cititoarele îl vor exact așa cum a venit. Ștergerea se face printr-un email la deletemydata@familytreedna.com trimis de pe adresa principală a contului și distruge și proba stocată.

23andMe: dă click pe numele tău, apoi pe Settings, derulează până la 23andMe Data și dă click pe View. Browse Raw Genotyping Data se descarcă pe loc; cererea completă de date se trimite pe email și poate dura câteva zile. Permanently Delete Data se află pe aceeași pagină și se finalizează printr-un link de confirmare din emailul tău. Este ireversibilă și nu ajunge la fișierele pe care le-ai distribuit deja în altă parte.

Iată ordinea în care aș face-o și aș face-o în săptămâna în care sosesc rezultatele. Mai întâi, salvează fiecare raport pe care ți-l arată. Tipărește-l pe fiecare ca PDF sau fă o captură de ecran, pentru că panoul este partea care dispare când o companie este vândută sau se închide. Apoi, descarcă fișierul brut, tot, VCF-ul și BAM-ul dacă ai loc pe disc, și pune o copie undeva care nu este laptopul pe care l-ai descărcat.

În al treilea rând, după ce ai verificat că se deschid copiile, întoarce-te și cere-le să îți șteargă datele și să distrugă proba. Fiecare companie de pe această pagină o face, pașii sunt mai sus. Ștergerea contului nu este întotdeauna același lucru cu ștergerea datelor sau a probei, așa că cere-le pe toate trei pe nume.

Motivul este simplu. Fișierul te identifică pentru tot restul vieții și îți identifică și copiii și frații, niciunul dintre ei nesemnând nimic. Odată ce ai propria copie, nu există niciun motiv să stea în continuare pe serverul altcuiva, așteptând următoarea breșă sau următorul cumpărător.

Nu sunt medic și nu diagnostichez pe nimeni, iar o variantă genetică nu este un diagnostic. Dacă porți o variantă, porți o variantă. Nu înseamnă că ai o afecțiune, nu înseamnă că o vei face și mulți oameni poartă lucruri pe care nu le exprimă niciodată. Ce îți dau genele este o hartă a tendințelor, nu un verdict.

Este o variabilă. Una mare și una pe care aproape nimeni nu o verifică. Exact așa aș trata-o, ca pe încă o informație care stă lângă analizele de sânge, simptomele tale și felul în care te simți de fapt, nu ca pe răspunsul care le anulează pe toate trei.

Dacă ceva dintr-un raport te îngrijorează, du-l la un medic care se poate uita la întreaga imagine, ideal un medic bun de medicină funcțională care îl va citi alături de analizele tale, nu izolat.