VEJA O QUE SEU INTESTINO REALMENTE FAZ

Uma linha por condição, um círculo por organismo que um estudo realmente mediu nela. Cada círculo é um link para esse estudo no PubMed.

O LPS é um pedaço da parede externa de certas bactérias intestinais. Acompanhe em quatro passos, do que o aumenta no seu intestino até as condições em que pesquisadores o mediram junto. Quatro desses passos são exatamente o que o Gut Barrier Panel lê.

O revestimento do seu intestino delgado tem a espessura de uma única célula, e proteínas chamadas junções firmes funcionam como as vedações entre essas células. A ocludina é uma dessas vedações. Outra proteína, a zonulina, consegue puxar as junções e abri-las. Quando elas afrouxam (aumento da permeabilidade intestinal), comida parcialmente digerida, resíduos bacterianos e toxinas começam a escapar e a acionar o sistema imune [1][2][3].

Uma das coisas mais estudadas que escapam é o LPS (lipopolissacarídeo), uma toxina liberada por certas bactérias intestinais. Mesmo quantidades minúsculas no sangue, o que se chama endotoxemia metabólica, já bastam para impulsionar inflamação crônica [4][5]. Níveis mais altos de LPS aparecem na obesidade, no diabetes tipo 2, na esteatose hepática e na doença cardíaca, e é por isso que mais pesquisas hoje apontam a barreira intestinal como causa a montante da inflamação, e não como efeito colateral [4][5][6].

Toda vez que você engole, manda uma dose da sua boca direto para dentro do intestino. O dia todo, todos os dias. Isso não é metáfora, é encanamento, e pesquisadores que sequenciaram a boca e as fezes das mesmas pessoas encontraram bactérias orais fazendo a viagem rotineiramente e se instalando lá embaixo, muito mais quando há doença presente [28]. Ou seja, sua boca não é um sistema separado que por acaso fica acima do intestino. Ela é a porta de entrada, e o que vive atrás dela é entregue.

Então funciona nas duas direções. Uma boca saudável semeia silenciosamente um intestino saudável todo dia, sem nenhum esforço, e é por isso que limpar sua boca é uma das jogadas a montante mais baratas que você tem à mão. Uma boca inflamada faz o oposto. Sua boca também tem uma barreira, e com doença gengival suas bactérias e as toxinas delas também entram na corrente sanguínea. A pior delas, liderada pela Porphyromonas gingivalis, não fica quieta: ela desregula o próprio intestino, reduzindo proteínas de junção firme e impulsionando a mesma endotoxemia [11][12][13]. A P. gingivalis também já foi encontrada em artérias entupidas e em mais de 90 por cento dos cérebros com Alzheimer [21][22].

A candida piora tudo, e as duas trabalham juntas. A candida danifica o revestimento intestinal diretamente com sua toxina candidalisina [15], e lá na boca ela faz parceria com a P. gingivalis, construindo biofilmes compartilhados que escondem a bactéria do seu sistema imune e dos seus antifúngicos [14]. Isso é uma aliança de verdade, não dois problemas lado a lado: a levedura dá cobertura à bactéria, a bactéria abre a barreira à força, e juntas elas a mantêm aberta. É um grande motivo pelo qual a candida é tão difícil de vencer, e por que um intestino danificado tem dificuldade de cicatrizar enquanto a boca segue inflamada.

Esta é a peça que quase ninguém checa. Se você já fez o trabalho no intestino, segurou a dieta por meses, e sua candida ainda não cede, uma boca inflamada semeando tudo de novo lá de cima é um dos primeiros motivos ocultos a descartar. É exatamente isso que o Oral Microbiome Profile rastreia, e é por isso que ele fica na Rodada 1 e não em uma lista de extras.

Se você tem predisposição genética, uma barreira permeável é uma parte reconhecida de como a doença autoimune começa. Quando proteínas não digeridas, fragmentos bacterianos e toxinas chegam à corrente sanguínea, o sistema imune pode começar a atacar o próprio tecido [3][7]. Esse é o trabalho do Dr. Alessio Fasano, que descobriu a zonulina e mostrou como ela funciona como uma porta para a inflamação e a autoimunidade. O aumento da permeabilidade já foi documentado na síndrome do intestino irritável, na doença inflamatória intestinal e no diabetes tipo 1 [10].

Seu intestino e seu cérebro estão em conversa constante nos dois sentidos: pelo nervo vago, pelo sistema imune e pelas substâncias que suas bactérias intestinais produzem. Essa ligação tem nome, eixo microbiota-intestino-cérebro, e é uma das áreas mais ativas da neurociência hoje [23][24].

A barreira permeável das seções acima faz parte da história. Quando o LPS e fragmentos bacterianos cruzam para a corrente sanguínea, a inflamação que vem depois não para na parede do intestino. Pesquisadores que mediram respostas imunes a bactérias intestinais em pessoas com depressão maior encontraram os marcadores de uma barreira permeável elevados, e propuseram essa translocação como parte do quadro inflamatório da depressão [25].

O trabalho mais impressionante corre na direção oposta. Quando bactérias intestinais de pessoas com depressão foram transferidas para animais criados livres de germes, esses animais passaram a apresentar comportamento tipo depressivo e mudanças no metabolismo que animais que receberam bactérias de doadores saudáveis não apresentaram [26][27]. Isso não é afirmar que bactérias causam depressão em uma pessoa, e ninguém está afirmando isso. Significa que o intestino não é espectador no humor, e é uma das poucas variáveis a montante que você consegue de fato medir e trabalhar.

Então esta é uma variável, uma variável real, e quase ninguém a checa. Ansiedade e depressão são sérias e merecem cuidado de verdade de um profissional de saúde mental licenciado. Nada aqui substitui isso, e um painel laboratorial não é um diagnóstico. Mas se você vem trabalhando sua mente há anos e nunca olhou uma vez para o seu intestino, esta é a porta que ninguém abriu.

Se você continua comendo alimentos aos quais seu sistema imune reage, o revestimento do intestino segue inflamado, alimentando a permeabilidade e impedindo a cicatrização [8][9]. Normalmente, descobrir seus gatilhos significa uma longa dieta de eliminação: cortar grupos alimentares inteiros e reintroduzi-los devagar. O exame pula quase tudo isso. Você descobre exatamente quais alimentos são o problema e evita só esses. A única exceção é a candida: se você tem um crescimento excessivo, ainda precisa evitar os alimentos que a alimentam enquanto traz tudo de volta ao equilíbrio, independentemente dos resultados de sensibilidade.

Gengivas saudáveis não sangram, nunca. Se as suas sangram quando você passa fio dental ou escova, isso é inflamação e um dos primeiros sinais de doença gengival [16]. Uma camada branca e espessa na língua pode indicar candida oral [17]. Três ou mais infecções por fungos em um ano é candida em cerca de nove de cada dez casos [18]. Pesquisadores também estão levando a sério a ligação da candida com o câncer: ela produz compostos cancerígenos como o acetaldeído, e a evidência mais forte a associa ao câncer de boca [19][20].

Os KBMO FIT panels (22, 132 ou 176 alimentos), cada um combinado com um Gut Barrier Panel, medem sua reatividade imune a alimentos e aditivos específicos, além do quanto o revestimento está permeável. O GI-MAP é um exame de fezes baseado em DNA que mapeia bactérias, leveduras, parasitas e marcadores de digestão, inflamação e atividade imune, com complementos opcionais de zonulina e StoolOMX. O Oral Microbiome Profile mapeia as bactérias da sua boca, incluindo os patógenos periodontais. Três portas: seus alimentos, seu intestino e sua boca.

Jess fez esse mesmo perfil em si mesmo e o resultado voltou com complexo vermelho e complexo laranja, que é como volta o da maioria das pessoas. Ele não tinha sintomas em nenhuma das duas vezes em que testou, e o dentista dele nunca havia mencionado nada. Foi preciso uma amostra de saliva para enxergar.

Ele seguiu uma rotina diária sem nenhum antibiótico: dois probióticos orais (ProBiora e BLIS K12 e M18), uma escova sônica, um irrigador oral, creme dental de nano hidroxiapatita e os enxaguantes. No reteste o complexo vermelho ficou abaixo do limite de detecção e o organismo restante do complexo laranja havia caído para uma fração pequena de onde começou, bem dentro da faixa saudável.

O detalhe que fez a diferença: o enxaguante de zinco foi para o reservatório do irrigador oral com água morna. Um enxaguante bochechado toca a superfície do dente, mas o complexo vermelho vive lá no fundo da bolsa periodontal, onde o bochecho nunca chega. O irrigador leva a mesma solução sob pressão direto para dentro dessa bolsa. Os mesmos produtos que a maioria já tem em casa, uma entrega completamente diferente.

Faça em três fases. Eliminar: enxaguante de zinco no reservatório enquanto houver infecção ativa. Confirmar: refaça o exame por volta dos noventa dias, porque quem diz que você terminou é o exame, não o calendário. Repovoar: zinco fora, apenas enxaguantes suaves, probióticos à noite depois de escovar, para que se assentem sobre uma superfície limpa e colonizem. Eliminar o complexo vermelho leva junto suas bactérias boas, que é exatamente o que deve acontecer, e exatamente por isso a fase três não é opcional.

Duas coisas pertencem à cadeira de um bom dentista biológico. Meça suas bolsas periodontais com um bom dentista biológico, porque o número decide o procedimento: de 1 a 3 mm pede tratamento gengival, 4 mm ou mais exige raspagem e alisamento radicular, e a interrupção completa do biofilme é o objetivo dos dois. E comece o protocolo pelo menos um dia antes dessa limpeza, não depois, porque as horas seguintes a uma raspagem são a janela mais aberta que sua boca vai ter. Mais uma coisa que ninguém comenta: esses organismos passam entre pessoas que compartilham saliva, então, se o seu resultado for positivo, peça para seu parceiro testar e faça o protocolo junto com você.

Ver o Oral Health Bundle Ler a história completa

Há dois tipos de teste nesta página e eles entregam coisas bem diferentes.

Um teste por chip lê algumas centenas de milhares de posições escolhidas. A 23andMe te dá um arquivo zip de cerca de 5 a 7 megabytes que abre em um arquivo de texto simples de uns 15 a 25 megabytes, com algo entre 550.000 e 700.000 posições. A FamilyTreeDNA te dá um CSV comprimido do mesmo tamanho, embora só liberem as posições em que confiam, então você recebe o conjunto selecionado deles em vez de tudo que a máquina leu.

Um teste de sequenciamento lê tudo, cerca de três bilhões de posições, umas 30 vezes cada uma. Você recebe três arquivos. O BAM é o alinhamento completo e ocupa de 80 a 120 gigabytes, então planeje seu armazenamento antes de baixar. O FASTQ são as leituras brutas. O VCF é a lista dos pontos onde seu DNA difere da referência, e é esse que quase toda ferramenta de análise quer. Sem compressão ele ocupa de 10 a 20 gigabytes. Comprimido cai para 1 a 2 gigabytes.

Então o resumo honesto é este. Um arquivo de chip é pequeno o bastante para mandar por e-mail. Um genoma completo não é, e você vai precisar de espaço real em disco e paciência no download.

A maioria dos lugares que lêem seus dados quer o VCF, e quase todos querem comprimido. Primeiro a boa notícia: a maioria das empresas de sequenciamento já te entrega um arquivo terminado em .vcf.gz, e o .gz quer dizer que já está comprimido. Se o seu termina assim, acabou, pule isso tudo e envie do jeito que está.

Se o seu arquivo termina em .vcf puro, veja como comprimir.

No Mac ou no Linux, abra o Terminal, vá até a pasta com o arquivo e rode gzip -k seuarquivo.vcf. O -k mantém o original em vez de substituir, o que importa quando o download levou um dia. Você vai ter seuarquivo.vcf.gz ao lado.

No Windows, instale o 7-Zip, clique com o botão direito no arquivo, escolha 7-Zip, escolha Adicionar ao arquivo e defina o formato como gzip. Você terá o mesmo resultado .vcf.gz.

Se você já tem ferramentas de bioinformática instaladas, bgzip seuarquivo.vcf é o padrão em genômica e algumas ferramentas pedem exatamente isso. O gzip comum é aceito em quase todo lugar, então não saia instalando nada por causa disso a menos que alguma ferramenta peça.

Uma coisa que vale saber antes de começar. Comprimir um VCF de genoma completo demora e precisa de espaço livre para as duas cópias ao mesmo tempo. Faça quando não precisar da máquina.

Nenhuma delas é minha e eu não ganho nada com elas. São simplesmente para onde o arquivo vai depois que você o tem. Os preços mudam, então confira antes de pagar.

O Promethease é o mais abrangente. Ele cruza seu arquivo com o SNPedia e devolve milhares de associações, e funciona desde 2008. O limite de envio é de 4 gigabytes, então um VCF de genoma completo comprimido cabe.

O Genetic Genie oferece painéis de metilação e detoxificação sem custo, que é o que a maioria das pessoas do mundo da medicina funcional realmente procura. O limite de envio deles é de 1 gigabyte, e a própria orientação deles diz que um sequenciamento mais profundo dá resultados mais precisos. Um arquivo de chip sempre cabe. Um genoma completo comprimido às vezes não, e se o seu passar do limite você vai precisar filtrar antes, o que vai bem além de uma instrução rápida como esta.

O SelfDecode funciona por assinatura e é o mais polido do grupo. Xcode Life e NutraHacker vendem relatórios avulsos um a um. O GEDmatch serve para encontrar parentes e não para saúde, e aceita envios da maioria das empresas de teste, que é como as pessoas encontram correspondências entre serviços que não conversam entre si.

Antes de enviar para qualquer lugar, veja o que aquele site diz que faz com seu arquivo. Você está entregando a informação mais identificável que tem, e ela identifica seus parentes de sangue também, e ninguém perguntou a eles.

Todas essas empresas entregam o arquivo, mas só umas poucas deixam a um clique. As outras fazem você procurar, e uma delas coloca um cronômetro. Aqui está onde o download fica em cada uma, pela minha última conferência. Menus mudam, então se um passo não bater, procure na central de ajuda deles as palavras raw data.

Sequencing.com: entre, abra My Genomes, escolha o genoma e depois a aba Files na coluna da esquerda. Cada arquivo (FASTQ, BAM, VCF) tem o próprio download na coluna Actions, e a mesma coluna tem a lixeira quando você quiser apagar.

Nucleus: entre, abra Account settings, ou escolha Downloads no menu sob o seu nome. Você pode levar o VCF, CRAM, FASTQ e os arquivos estruturais e de número de cópias, mais uma cópia já formatada para Promethease ou GEDmatch. Para apagar, escreva para concierge@mynucleus.com a partir do e-mail da conta.

Dante Labs: entre, abra o Genome Manager e baixe por ali. Dois avisos. Cada link de download morre 60 segundos depois do clique, então comece a transferência na hora e não guarde o link para depois. E há clientes relatando que o FASTQ e o BAM somem da conta depois do primeiro mês enquanto o VCF fica, então baixe os arquivos grandes cedo. A exclusão é um pedido em support.dantelabs.com.

FamilyTreeDNA: ative primeiro a autenticação em dois fatores, sem ela o download não roda. Depois Results & Tools, Autosomal DNA, Download Raw Data, e pegue o arquivo Build 37 Concatenated. Não descompacte nem renomeie, os leitores querem exatamente como veio. A exclusão é um e-mail para deletemydata@familytreedna.com enviado do endereço principal da conta, e destrói também a amostra guardada.

23andMe: clique no seu nome, depois Settings, desça até 23andMe Data e clique em View. Browse Raw Genotyping Data baixa na hora; o pedido de dados completo chega por e-mail e pode levar dias. Permanently Delete Data fica nessa mesma página e termina por um link de confirmação no seu e-mail. É irreversível, e não alcança arquivos que você já compartilhou em outro lugar.

Esta é a ordem em que eu faria, e faria na semana em que os resultados chegam. Primeiro, salve todo relatório que eles mostram. Imprima cada um em PDF ou tire captura, porque o painel é a parte que some quando a empresa é vendida ou fecha. Segundo, baixe o arquivo bruto, tudo, o VCF e o BAM se tiver disco, e coloque uma cópia em algum lugar que não seja o notebook onde ele desceu.

Terceiro, depois de conferir que as cópias abrem, volte e peça para apagarem os seus dados e destruírem a amostra. Toda empresa desta página faz isso, os passos estão acima. Apagar a conta nem sempre é o mesmo que apagar os dados ou a amostra, então peça os três pelo nome.

O motivo é simples. O arquivo identifica você pelo resto da vida, e identifica os seus filhos e irmãos também, e nenhum deles assinou nada. Quando você tem a sua própria cópia, não há razão para ele continuar no servidor de outra pessoa esperando o próximo vazamento ou o próximo comprador.

Eu não sou médico e não estou diagnosticando ninguém, e uma variante genética não é um diagnóstico. Carregar uma variante significa que você carrega uma variante. Não significa que você tem uma condição, não significa que vai ter, e muita gente carrega coisas que nunca expressa. O que seus genes te dão é um mapa de tendências, não um veredito.

É uma variável. Uma grande, e uma que quase ninguém verifica. É exatamente assim que eu trataria, como mais uma informação ao lado dos seus exames, dos seus sintomas e de como você realmente se sente, em vez da resposta que passa por cima dos três.

Se algo em um relatório te preocupar, leve a um médico que consiga olhar o quadro inteiro, de preferência um bom médico de medicina funcional que leia junto com seus exames e não isoladamente.